Weill Cornelli Meditsiinikeskus teeb kataloogi bioloogilisest tumeainest – tohutust viiruste ökosüsteemist, mis elab meie sees ja peal.
Enamik viirusi ei tee inimesi haigeks. Viroloogid on juba ammu kahtlustanud, et maailm on täis viirusi, mis ei põhjusta haigusi ja mida traditsioonilised laboritestid ei suuda tuvastada. Nüüd on DNA ja RNA sekveneerimise ning bioinformaatika hiljutised edusammud lõpuks võimaldanud teadlastel seda bioloogilist tumeainet uurida. Mõistetavalt on suur osa tööst keskendunud sellele, kuidas viroomi muutused võivad haigustele kaasa aidata. Uus projekt käsitleb aga ka sama olulist küsimust: milline näeb välja terve viroom?
Millised on normaalsed viirused?
„Me tahame paremini mõista viiruste varieeruvust, arvukust ja mitmekesisust kogu maailmas, eriti inimeste seas, kes elavad lihtsalt normaalset elu,“ ütles dr Christopher Mason, Weill Cornelli meditsiinikeskuse genoomika ja arvutusliku biomeditsiini professor ning projekti juhtivteadur. Dr Alexander Lucaci lisas, et „Suurem osa sellest, mida me viiruste kohta teame, käib patogeensete viiruste kohta, kuid nüüd püüame mõista neid, mis lihtsalt meis eksisteerivad, ja meil pole tegelikult aimugi, mida nad teevad.“
See töö on osa mitme asutuse koostööprojektist nimega Viromes Across Space and Time (VAST), mida toetab Riiklik Vananemise Instituut. Inimese viiruste kaardistamine valgustab inimese bioloogia olulist aspekti, mida varem oli võimatu uurida, ning loob baasandmete kogumi, mis aitaks haigusi ennetada, diagnoosida ja ravida.

Dr. Christopher Mason, foto Ashley Jones
Kuidas muutub normaalne viroom haiguste puhul
VAST tugineb suurele proovikogule, mille dr Masoni labor on juba kogunud. Teadlased jälgivad katses osalevaid inimesi projekti viieaastase kestuse jooksul ja ka pärast seda. Osalejate seas on inimesed lastest ja noorukitest eakateni, nad on pärit maailma eri paigust ja neil on lai elulugude spekter.
„Meil on kümneid tuhandeid proove,“ ütles dr Lucaci, kes juhib projekti bioinformaatika analüüsi.
Weill Cornelli Meditsiinikeskus teeb koostööd Stanfordi Ülikooliga.
„See alusandmete kiht aitab meil näha, kuidas normaalne viroom muutub olenevalt erinevatest haigustest või inimese taustast, ning näha ka viiruseid, mis on tavaliselt asümptomaatilised ja muutuvad oportunistlikeks patogeenideks,“ ütles dr Mason, kes on ka Weill Cornelli Meditsiinikeskuse füsioloogia ja biofüüsika professor.
Allikas: https://weill.cornell.edu/

Loe ka:
Teie hambahari ja dušiotsikud kubisevad viirustest
Lõuna-Ameerikas levib Oropouche viirus! Kas järgmine Zika?
Viirus, mis kasutab inimese sisse saamiseks Trooja hobust
Inimesed nakatavad loomi viirustega sagedamini kui vastupidi
Vaktsineerimine võib vähendada ka Parkinsoni riski
Vöötohatise vaktsiin vähendab dementsuse riski
Vöötohatise vaktsiin vähendab dementsuse riski – jätkulugu